一、 高新申请书 （先从网上申报，然后从网上打印一式五份）
二、 企业法人营业执照复印加盖企业的公章）
三、 税务登记证复印件（加盖企业的公章）
四、 近三年的财务审计报告、二个专项审计报告（研发费、上年度的技术性收入）
五、 其 他：
1、 申报企业高新认定的材料清单。
2、 知识产权证书复印件（加盖企业的公章）
3、 立项报告（与RD表一致）
4、 建立了研发投入核算体系——财务制度
5、 与科研机构签订的产学研合同
6、 设立的研发机构和设施和设备清单（附买进设施和设备的发票及合同）
7、 三年的研发人员的绩效考核文件
8、 企业的科技人员花名册（累计实际工作时间在183天以上；附带社保、劳动合同）。假如企业提到了有多少博士、研究人员的学历及职称可以提供复印件。
9、 科研成果转化项目材料（清单，合同，商品质量检验证书等）
技术收入的假如是提供商品的就提供商品的检测报告或是第三方提供的鉴定报告及销售合同（提供发票附在合同后面）。假如是提供技术服务的，需要提供技术服务合同及发票而且做技术合同登记。所有的收入与PS表一致。
10、 企业的资质、获奖证明材料等。
11 企业打算所有手工材料打算一式五份（肯定有一份原件，4份复印件盖公章）。
高新技术企业认定程序有五个环节，包括自我评注册登记、打算并提交材料、组织审查与认定、公示及颁发证书.申请企业要完成的是前三项,其中材料打算是最重要的一项工作.
《工作指引》二(3)列举了需要提交的材料种类,包括认定申请书,两个鉴证报告(近三个会计年度研究开发费用鉴证报告、近三个会计年度的财务报表鉴证报告含资产负债表、利润及利润分配表、现金流量表)(实际年限不足三年的按实际经营年限),一个审计报告(近一个会计年度高新技术商品(服务)收入专项审计报告),以及技术创新活动证明材料.
依据《工作指引》规定,企业申请高新技术企业的认定申请书由《企业基本信息表》、《企业研究开发项目表》、《上年度高新技术商品(服务)情形表》、《近三年内获取自主知识产权汇总表》、《企业年度研究开发费用结构明细表》五种表格组成,在填表时要注意所有的财务数据都来自专项审计报告,要和鉴证报告、审计报告完全一致.其中《企业基本信息表》中"近三年内获取的自主知识产权数"一栏所填内容,应与技术创新活动证明材料一一对应并完全吻合;"人力资源情形"栏要注意两个比例要求,即大专以上学历的科技人员要占(申请)当年职工总数30%以上,研发人员占职工人数10%以上;其他一些文字描述的内容多以数据阐述,少用华丽词句,注意言简意赅.
在申请认定高新技术企业工作中,研究开发费用的归集与核算是一项基础而重要的工作,它不仅关系到申请认定能否历经,还舍及计算企业所得税时技术开发费的加计扣除,对企业的利益有很大的影响.提醒企业注意以下几个方面:
提示一:企业可考虑在"管理费用"明细账下设"研发费用"明细账,按各"研发项目"归集核算"内部研究开发投入"和"委托外部研究开发投入".这样发生的全部研发费用就在一本账上反映,把在打算申请认定材料时要做的工作,当成日常事务给做了.既可以便于申请认定时注册会计师的审计核对,也有利于计算应纳税所得额时技术开发费的加计扣除,主管税务机关审核起来也方便.在填写《企业年度研究开发费用结构明细表》时,只需抄录注册会计师的审计报告即可.
提示二:企业应当设有专门的科研人员名册,一方面便于申请认定时对科研人员比例要求的核对;另一方面,便于在费用归集时的相互对应.企业应当和科研人员订有劳动合同,缴纳社会保险,强调的是科技人员在企业工作时间每年很多于半年(183天).在支付科研人员人工费时,可以考虑集中制表且与劳动合同相一致.
提示三:企业在研发工作开展后发生的设备折旧和无形资产摊销可直接计算,企业可依据批准的研发项目立项报告,把"固定资产"和"无形资产"的管理部门调整为研发机构,以便正确计算折旧和摊销额.
提示四:设计(规划)费用、装备调试费要有合法证据,这些费用往往是发生在企业内部中,没有多少外来原始凭证,事后很难收集和核实,比如调试设备的次数和每次消耗电费、相关技术工人的人工.所以,企业应按内部核算的要求,做好原始记录和凭证,及时履行审批程序,逐月结算入账.
提示五:委托外部研究开发费用要注意项目成果及与企业主要业务紧密相关是衡量外部研发费用能否计入的重要因素.在签订委托合同时,应当特别注明.另外,发生的全部委托外部研发费用在申请认定时只能按80%计算,但在计算加计扣除时则没有这样的限制.
即使《认定方法》明确高新技术企业的认定不历经主管税务机关,但企业仍应当注意与主管税务机关做好沟通,及时知晓和掌握当地有关认定工作的具体规定.企业在取得高新技术企业资格后应把证书及时告知主管税务机关,而不要到申报企业所得税时才拿出来.假如减免税条件发生变化,应在15日内报告;假如不附和条件,就主动纳税,以免被追缴,承担滞纳金并留下不良记录.
6. 经具有资质构出具的企业近三个会度研究开发和近一个会计年度高新技术商品（服务）收入专项审计或鉴证报告，并附研究开发活动讲明材料；
7. 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务会计报告（包括会计报表、会计报表附注和财务情形讲明书）；
8. 近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表。
（二）专家评审
认定机构应在附和评审要求的专家中，随机抽取组成专家组。专家组对企业申报材料进行评审，提出评审意见。
（三）审查认定
认定机构结合专家组评审意见，对申请企业进行综合审查，提出认定意见并报领导小组办公室。认定企业由领导小组办公室在“ 高新技术企业认定管理工作网”公示10个工作日，无异议的，予以备案，并在“高新技术企业认定管理工作网”公告，由认定机构向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”；有异议的，由认定机构进行核实处理。
一、进行自我评价
企业在申请高新技术企业认定之前应认真阅读相关文件和认定标准，应对照《认定方法》进行客观自我评价。认为附和认定条件的，则可在“高新技术企业认定管理工作网”上进行企业注册登记。
二、网上进行注册登记
企业登录“ 高新技术企业认定管理工作网”（网址：按要求填写《企业注册登记表》，并历经网络系统提交至认定机构。认定机构核对企业注册信息，在网络系统上确认激活后，企业可以开展后续申报工作。
三、企业提交材料
企业登录“高新技术企业认定管理工作网”，按要求填写《 高新技术企业认定申请书》（附件2），历经网络系统提交至认定机构，并向认定机构提交下列书面材料：
1.《高新技术企业认定申请书》（在线打印并签名、加盖企业公章）；
2.企业高新技术商品（服务）的关键技术和技术指标的具体讲明，相关的生产批文、认证认可和资质证书、商品质量检验报告等材料；
3.证明企业依法成立的《营业执照》等相关注册登记证件的复印件；
4.企业职工和科技人员情形讲明材料，包括在职、兼职和临时聘用人员人数、人员学历结构、科技人员名单及其工作岗位等；
5.经具有资质介机构出具的企业近三个会计年度（实际年限不足三年的按实际经营年限，下同）研究开发费用、近一个会计年度高新技术商品（服务）收入专项审计或鉴证报告，并附研究开发活动讲明材料；
6.经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务会计报告（包括会计报表、会计报表附注和财务情形讲明书）；
7.知识产权相关材料（知识产权证书及反映技术水准的证明材料、参与制定标准情形等）、科研项目立项证明（已验收或结题项目需附验收或结题报告）、科技成果转化（总体情形与转化形式、应用成效的逐项讲明）、研究开发组织管理（总体情形与四项指标附和情形的具体讲明）等相关材料；
8.近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表（包括主表及附表），对涉密企业，须将申请认定高新技术企业的申报材料做脱密处理，确保涉密信息安全，申报表肯定有主管税局加盖业务专用章。
四、专家评审
认定机构收到企业完整的申请材料后，组织专家审查，专家组长汇总各位专家分数，按分数平均值填写《 高新技术企业认定专家组综合评价表》。具备条件的地区可进行网络评审。认定机构结合专家组评审意见，对申请企业申报材料进行综合审查（可视情形对部分企业进行实地核查），提出认定意见，确定认定高新技术企业名单，报领导小组办公室备案。
五、认定报备
认定机构结合专家组评审意见，对申请企业申报材料进行综合审查（可视情形对部分企业进行实地核查），提出认定意见，确定认定高新技术企业名单，报领导小组办公室备案，报送时间不得晚于每年11月底。
六、公示公告
经认定报备的企业名单，由领导小组办公室在“ 高新技术企业认定管理工作网”公示10个工作日。无异议的，予以备案，认定时间以公示时间为准，核发证书编号，并在“高新技术企业认定管理工作网”上公告企业名单，由认定机构向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”（加盖认定机构科技、财政、税务部门公章）；有异议的，须以书面形式实名向领导小组办公室提出，由认定机构核实处理。领导小组办公室对报备企业可进行随机抽查，对存在问题的企业交由认定机构核实情形并提出处理建议。
假如企业没有经验或没有专人整理材料，可寻求第三方中介企业代理申报，可节约很多时间。
